Electron 应用程序的源代码通常是以明文形式存放在应用程序的资源文件夹中的，这使得它们容易被查看和修改。为了提高 Electron 应用程序的安全性，可以采取以下措施来防止或至少增加反编译的难度：

1. 源代码混淆：使用工具如 JavaScript Obfuscator 对 JavaScript 代码进行混淆，使得代码难以阅读和理解。混淆后的代码执行功能不变，但是变量名、函数名会被替换成无意义的字符组合，逻辑结构也会变得复杂。

2. 源代码压缩：通过工具如 UglifyJS 或 Terser 对代码进行压缩，移除空格、注释、重写代码结构等，以减少代码体积和提高代码的不可读性。

3. 原生模块：将一些核心逻辑或敏感代码编写为原生模块（如 C++ 插件），然后在 Electron 中通过 Node.js 的 require 或 import 引入。原生模块编译成二进制文件，难以直接阅读。

4. 代码签名：对你的应用程序进行代码签名，这不会阻止反编译，但是可以确保用户知道代码已被修改。如果签名不匹配，用户可以得知应用可能已被篡改。

5. 加密关键文件：可以对应用程序中的关键文件进行加密，并在运行时解密。这需要在应用程序中嵌入解密逻辑，这样即使文件被提取，也无法直接使用。

6. 使用专业的保护工具：市面上有一些专业的工具和服务，如 bytenode，可以将 JavaScript 代码编译为 V8 引擎的字节码。这样即使代码被提取出来，也难以还原成原始的 JavaScript 代码。

7. 环境检测：在应用程序中加入环境检测逻辑，如检测调试工具、运行环境等，一旦检测到非法调试或运行环境，应用程序可以自行终止运行。

8. 更新和维护：定期更新应用程序，修复已知的安全漏洞，增加攻击者的攻击成本。

需要注意的是，没有任何方法可以完全防止反编译。上述措施可以提高应用程序的安全性，但是如果有足够的动机和资源，专业人员仍然有可能通过逆向工程来理解和修改应用程序的代码。因此，最好的做法是不在客户端存储敏感信息，将关键的业务逻辑放在服务器端处理。